Sequence analysis

Une application pour automatiser le processus d’analyse d’une séquence ADN. Elle vise à traiter quelques prblèmes principaux de Rosalind problems .

Technologies

• Python
• Tkinter

Fonctionnalités

• Lire et traiter un fichier contenant les séquences d’ADN.
• Générer une chaîne ADN aléatoire d’une longueur donnée
• Vérifier la validité de la chaîne ADN si cette dernière est lue à partir d’un fichier.
• Calculer les fréquences des bases nucléiques dans la chaîne ADN.
• Transcrire la chaîne ADN en une chaîne ARN.
• Transcrire la chaîne ARN résultante en protéines (i.e., acides aminés)
• Calculer le complément inverse de la chaîne ADN.
• Calculer le taux de GC de la séquence ADN.
• Calculer les fréquences de codons dans la chaîne ADN.
• Calculer la masse protéique.
• Effectuer l'épissage d'ARN.
• Sauvegarder les résultats obtenus dans un fichier.

Installation

pip install tkinter
pip install random
pip install sys

git clone https://github.com/sirineFoudili/Sequence-analysis.git