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Pacote para fazer o download dos casos diários de coronavirus no Brasil desde diferentes fontes

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Download de dados de COVID-19 no Brasil

coronabr é um pacote de R para fazer download e visualizar os dados dos casos diários de coronavírus (COVID-19) disponibilizados por diferentes fontes:

Nosso objetivo

O nosso objetivo é facilitar o acesso aos dados de diferentes fontes, usando ferramentas de acesso aberto e que permitam reprodutibilidade.

O código é aberto. Entre em como usar para um exemplo de como utilizar o pacote. Compartilhe.

Fazemos ciência aberta, democrática e reprodutível. Este é um trabalho em desenvolvimento. Para entender como contribuir, clique aqui.

Aviso!

Disponibilizamos aqui atualizações dos gráficos. Sabemos que deve haver maneiras responsáveis de apresentar estes dados e que as comparações entre regiões e países dependem de muitas variáveis.

Os dados são referentes aos casos notificados. É sabido que temos subnotificação e atraso nas notificações. Assim, mais do que nunca, não refletem a epidemia em si.

Sobre os dados

Antes de mais nada, declaramos nossa postura alinhada com as ideias de uma ciência de dados responsável, compromissada e feminista. Somos pessoas alinhadas com o manifest-no, refutamos regimes de dados prejudiciais e nos comprometemos a novos futuros de dados.

Apesar de acreditarmos no acesso sem distinção a dados abertos, não recomendamos que toda análise que possa ser feita o seja. Ao se tratar de uma situação de saúde pública delicada, visualizações, extrapolações, e predições devem ser feitas com todo cuidado, lembrando que a qualidade dos dados é incerta e que todo dado diz respeito a uma pessoa.

No Brasil, a notificação de casos carrega consigo vieses espaciais, econômicos e de classe que não podem ser ignorados. Para ver modelos responsáveis de previsão do crescimento no número de casos veja o Observatório COVID-19 Brasil (um grupo colaborativo de pessoas cientistas brasileiras) e o Mapa de previsão da propagação da COVID-19 por contágio comunitário no Brasil.

Nota sobre os dados disponibilizados pelo Ministério da Saúde

  • A partir de 2020-03-14, a notificação de casos graves de COVID-19 foca apenas nos casos graves que são atendidos nos hospitais.
  • Até 2020-03-18 o ministério de saúde brasileiro disponibilizou os dados de casos de coronavirus COVID-19 discriminados por estado na página http://plataforma.saude.gov.br/novocoronavirus/#COVID-19-brazil
  • Entre 2020-03-18 e 2020-03-25, a página original do Ministério da Saúde parou de funcionar e os dados de casos de coronavirus COVID-19 discriminados por estado foram divulgados em apresentações de powerpoint e PDFs no blog do Ministério. Adriano Belisario fez a compilação manual destes dados neste repositório
  • A partir de 2020-03-26 o Ministério de Saúde brasileiro disponibilizou os dados de casos de coronavirus COVID-19 na página https://covid.saude.gov.br/
  • A partir de 2020-03-28 a opção de fazer download da série histórica por casos voltou a estar disponível. Depois disso, o padrão tem mudado frequentemente, inclusive no formato de disponibilização dos dados que agora é em .xls e não mais .csv. Neste momento, temos uma função estável get_corona_minsaude() para o download desses dados (instruções de como usar aqui).

Visualizando os dados

Importante lembrar que desde 2020-03-27 tem muitos testes sem resultados e que os dados não refletem a epidemia e sim as notificações - e que essas estão atrasadas devido ao atraso no resultado dos testes.

Entre aqui para acompanhar os casos na América Latina (versão em espanhol aqui)

Crescimento nacional no número de casos de COVID-19

Entendendo o aumento diário de COVID-19

Crescimento do número de casos de COVID-19 nos estados mais afetados

Para saber mais:

Dúvidas, contribuições e sugestões, poste um issue aqui, escreva-nos um e-mail ou nos encontre no twitter (Sara, Andrea ou Karlo).

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