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Repositório para apresentação de código desenvolvido pelo grupo 3 para a UC Algoritmos para Análise Sequências Biológicas do Mestrado em Bioinformática, ano lectivo 23-24.

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Algoritmos para Análise de Sequências Biológicas, 2023/24

Grupo 3

Repositório criado por:

Algoritmos construidos

  • Métodos de strings
  • Tradução de codões e obtenção da cadeia complementar inversa para sequencias de DNA
  • Extração de todas as proteínas possívies codificadas nas varias open reading frames de uma sequencia de DNA
  • Alinhamento de sequências através de programação dinâmica/recursividade
  • Algoritmo de Needleman Wunsch
  • Blast
  • Motifs
  • Análise filogenética
Este repositório foi criado no ambito da UC Algoritmos para Análise de Sequências Biológicas (2023/24), do Mestrado em Bioinformática da Escola de Engenharia da Universidade do Minho, e tem como objetivo reunir os scripts e notebooks construídos ao longo da realização do trabalho. Neste repositório são apresentadas as implementações dos algoritmos leccionados no âmbito da UC. No código presente neste portfólio, encontra-se a documentação do código, Type hinting, Unit tests e todas as fontes onde se foi buscar código.

Este repositório destaca-se pela originalidade e a autoria do código escrito.

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Repositório para apresentação de código desenvolvido pelo grupo 3 para a UC Algoritmos para Análise Sequências Biológicas do Mestrado em Bioinformática, ano lectivo 23-24.

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