三倍体基因组

[liufuyan2016]

老师，您好
三倍体基因组划分成这样了，单套17条，还能有改善吗

[zhangrengang]

这是没分开，如果组装没问题，就很难再改善了，有可能是同源三倍体，用这个方法分不开。如果可用kmer很少，可以试试减少配置文件里的同源关系（原先17行3列改成比如10行3列+21行1列的），并降低-q参数（比如降到100）。