亚基因组分析

[zhdang]

张老师， 您好！正在用subphaser分一个异源四倍体的AB亚基因组，得到初步结果，请您帮忙看看。装出来的基因组共22条染色体，在subphaser分析后，一组为12条，另一组10条，目前这里比较迷惑，请您指点。结果如下图：

[zhangrengang]

证据倒是支持“一组为12条，另一组10条”，问题不大，主要是chr2+3=20和15+22=14两处不平衡，可能是杂交前两祖先染色体数量就不同，或者杂交后发生染色体重排。类似情况在异源四倍体芸薹属中也有，参考http://doi.org/10.1093/bib/bbad513。

[zhdang]

谢谢老师的回复和指导！！